Philippe Noirot



Travaux et recherches

Dr. Philippe Noirot est à la tête de "Systems Biology" et directeur adjoint de l'institut joint INRA/AgroParisTech MICALIS. Il a reçu un doctorat en génétique moléculaire (université Paris-sud, Orsay) avec le Dr. S.D. Ehrlich. Il a par la suite travaillé comme associé post-doctoral avec le Dr. R.P. Novick (PHRI, New-York), puis avec le Dr. R.D. Kolodner (DFCI, Harvard Medical School, Boston). En 1998, il est parvenu à la tête d'un groupe de recherche dédié à l'étude de la dynamique des chromosomes grâce à l'interactomique, associée à la génomique fonctionnelle ainsi qu'à des techniques d'ingénierie des chromosomes.

  • BaSysBio et  Basynthec

Dr. Noirot a été coordinateur de BaSysBio, un grand projet intégré FP6 (2006-2011) dédié au développement d'une approche biologique systémique afin de comprendre la structure régulatoire transcriptionnelle chez B. subtilis. Son laboratoire est activement impliqué dans l'identification d'interactions binaires de protéines (Double-Hybride de Levure); de complexes multi-protéiques (TAP); et de sites de liaison ADN à l'échelle du génome (ChIP-chip), en étroite collaboration avec le laboratoire INRA "Mathématiques, Informatique et Génome" (MIG). Le laboratoire du Dr. Noirot mène également l'effort de réduire le génome B. subtilis, en étroite collaboration avec le laboratoire du Dr. R.L. Stevens (Computation Institute, University of Chicago). Il est le coordinateur de BaSynthec, un projet collaboratif FP7 destiné à développer des approches synthétiques pour la biotechnologie avec B. subtilis.

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Publications

  • DELUMEAU, O., F. LECOINTE, J. MUNTEL, A. GUILLOT, E. GUEDON, V. MONNET, M. HECKER, D. BECHER, P. POLARD & P. NOIROT, (2011) The dynamic protein partnership of RNA polymerase in Bacillus subtilis. Proteomics 11: 2992-3001.

  • MARCHADIER, E., R. CARBALLIDO-LÓPEZ, S. BRINSTER, C. FABRET, P. MERVELET, P. BESSIÈRES, M. F. NOIROT-GROS, V. FROMION & P. NOIROT, (2011) An expanded protein-protein interaction network in Bacillus subtilis reveals a group of hubs: Exploration by an integrative approach. Proteomics 11: 2981-2991.

  • PONCET, S., M. SORET, P. MERVELET, J. DEUTSCHER & P. NOIROT, (2009) Transcriptional activator YesS is stimulated by histidine-phosphorylated HPr of the Bacillus subtilis phosphotransferase system. J. Biol. Chem. 284: 28188-28197.